De krokodillenschaar maakt gebruik van een hydraulisch aandrijfsysteem; het kernmechanisme omvat een hydraulische pomp die druk genereert om een hydraulische cilinder te bedienen, waardoor op hefboomwerking gebaseerde schuifkracht ontstaat. Tijdens bedrijf houdt een vasthoudinrichting eerst het metalen materiaal op zijn plaats; vervolgens drijft de hoofddrukcilinder het bewegende mes (bovenste mes) naar het stationaire mes (onderste mes), waardoor het metaal onder enorme schuifkracht wordt doorgesneden. De machine is genoemd naar de gelijkenis van zijn structurele actie met het openen en sluiten van de kaken van een alligator.
Alligatorscharen bieden drie bedieningsmodi: tippen, halfautomatisch en volledig automatisch. In de kruipmodus moet de knipknop continu ingedrukt worden gehouden om de machine te laten werken. In de halfautomatische modus activeert een enkele druk op de knop een volledige scheercyclus. In de volledig automatische modus werkt de machine continu zonder dat er op een knop hoeft te worden gedrukt, waarbij automatisch de volgorde van klemmen (neerdrukapparaat daalt), knippen (mes daalt), loslaten (neerdrukapparaat en mes intrekken) en opnieuw klemmen wordt doorlopen.
Vergeleken met mechanisch aangedreven scharen bieden hydraulische systemen voordelen zoals compact formaat, licht gewicht, lage traagheid, laag geluidsniveau, soepele werking, gebruiksgemak en eenvoudige implementatie van overbelastingsbeveiliging. Geavanceerde modellen bevatten snelwerkende circuits (bijvoorbeeld met behulp van snelle klepspruitstukken) om de afschuifsnelheid te verhogen, waardoor de snelheid wordt verhoogd van 8 naar 12 sneden per minuut zonder het motorvermogen of de pompverplaatsing te vergroten, waardoor de productiviteit wordt verhoogd. De hydraulische systemen maken doorgaans gebruik van patroonkleppen, die voordelen bieden zoals een eenvoudige constructie, weerstand tegen vervuiling en snelle responstijden.
Operators moeten volledig gefocust blijven en hun lichaam uit de buurt houden van de bewegende delen van de apparatuur en de snijzone om letsel door terugslag of breken van materiaal te voorkomen. De juiste bedieningsmodus moet worden geselecteerd op basis van de vorm en stabiliteit van het materiaal, en gevaarlijke handelingen, zoals het ophalen van items of het maken van aanpassingen, moeten worden vermeden binnen het werkbereik van de machine.
